น้ำปลาเป็นเครื่องปรุงที่มีอายุการเก็บค่อนข้างนาน เพราะผ่านกระบวนการหมักและมีปริมาณเกลือสูง แต่ถึงอย่างนั้น การเก็บรักษาอย่างถูกวิธีก็ยังสำคัญต่อคุณภาพของกลิ่น สี และรสชาติ
สิ่งแรกที่ควรทำคือปิดฝาขวดให้สนิททุกครั้งหลังใช้งาน เพื่อป้องกันอากาศเข้าไปทำปฏิกิริยากับน้ำปลา เพราะออกซิเจนอาจทำให้สีเข้มขึ้นและกลิ่นเปลี่ยนได้
ควรเก็บน้ำปลาในที่แห้งและหลีกเลี่ยงแสงแดดโดยตรง เนื่องจากความร้อนและแสงสามารถเร่งการเปลี่ยนแปลงของสีและรสชาติได้ หากเป็นไปได้ควรวางไว้ในตู้หรือมุมครัวที่อุณหภูมิคงที่
หลายคนสงสัยว่าควรแช่ตู้เย็นหรือไม่ จริง ๆ แล้วน้ำปลาไม่จำเป็นต้องแช่เย็น แต่หากเป็นน้ำปลาแท้ระดับพรีเมียมหรือสูตรโซเดียมต่ำ การแช่เย็นอาจช่วยรักษากลิ่นหอมได้ดียิ่งขึ้น
นอกจากนี้ ควรหลีกเลี่ยงการใช้ช้อนหรือภาชนะที่เปียกตักน้ำปลา เพราะอาจทำให้เกิดการปนเปื้อนและส่งผลต่อคุณภาพในระยะยาว
การเลือกบรรจุภัณฑ์ก็มีผลเช่นกัน ขวดแก้วมักช่วยรักษากลิ่นและรสชาติได้ดีกว่าขวดพลาสติก โดยเฉพาะเมื่อต้องเก็บเป็นเวลานาน
หากดูแลอย่างเหมาะสม น้ำปลาคุณภาพดีก็จะยังคงให้รสชาติกลมกล่อมและกลิ่นหอมอันเป็นเอกลักษณ์ได้ยาวนานทุกครั้งที่ใช้งาน
